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カラムフリーで低分子DNA 断片(≦ 50bp)が除去できる 核酸クリーンアップ用試薬
DNA Cleaner

本品は、有機溶媒やスピンカラムを使用せずに35 分間で50bp 以下のDNA 断片を効率よく除去できる試薬です。また、dsRNA の精製にも使用できます。PCR 後のプライマー、プライマーダイマー、dNTP、DNA ポリメラーゼの除去や制限酵素処理後の酵素等の除去に最適です。
また、ABI 社BigDye Cycle Sequencing kit で増幅したシークエンス用DNA サンプルをエタノール沈殿法により精製する際、本品を用いることでクリアなシークエンス結果が得られます。

DNA Cleaner01

特徴

  • カラムを使用せずにPCR 増幅産物を精製
  • 500 〜 2,500ng のDNA を高効率(90% 以上)に濃縮
  • 最短35分でPCR 後の核酸精製が可能
  • シンプルなプロトコール

DNA Cleaner 使用用途

プライマー除去 プライマーダイマー除去 dNTP 除 DNA 精製 シークエンス用
標識反応後精製
酵素除去 操作時間 処理容量

100 〜 10,000 bp
最短35 分 スタート試料と
同容量

原理

原理図はこちら

操作概要

DNA Cleaner03

カラム法との比較

DNA Cleaner Q社カラム法
Step 1 DNA溶液と等量のDNA Cleaner添加。 PCRサンプルに5倍容量の結合液を添加。その際、混和物の色が黄色にならなければ、3M酢酸Naを添加。
Step 2 10分間 静置。室温。 スピンカラムにStep 1.のサンプルを添加。
Step 3 10分間 遠心分離。室温。 1分間遠心分離。室温。
Step 4 上清除去。70%エタノール添加。 ろ液除去。洗浄液を添加。
Step 5 1分間 遠心分離。室温。 1分間遠心分離。室温。
Step 6 上清除去。5分間 乾燥。 ろ液除去。
Step 7 TE Buffer、滅菌水に溶解 1分間遠心分離。室温。
Step 8 FINISH 溶出液を50μL添加。1分間静置。
Step 9 - 直接スピンカラムのメンブレンに溶出液を添加。
Step 10 - 1分間遠心分離。室温。
Step 11 - FINISH
所要時間 〜35分 〜10分
遠心分離回数 2回 4回

DNA Cleaner 使用例

1)低分子DNA(50bp 以下)の除去

DNA Cleaner05

レーン1.:DNA Step Ladder (25-500bp)
レーン2.:DNA Step Ladder (25-500bp)(DNA Cleaner 処理)
レーン3.:DNA Step Ladder (25-500bp)(T 社Kit)
レーン4.:DNA Step Ladder (25-500bp)(Q 社Kit)

図1  DNA Cleaner による50bp 以下のDNA 断片の除去
本品を使用した結果、50bp および25bp のDNA 断片を除去でき、75bp 以上のDNA 断片を回収できた。Q 社Kit よりも50bp 以下のDNA 断片を効率よく除去できた。

2)高分子DNA(200bp 以上)の回収

DNA Cleaner06

レーン1.:DNA Ladder
レーン2.:DNA Ladder (DNA Cleaner 処理)
レーン3.:DNA Ladder (T 社Kit)
レーン4.:DNA Ladder (Q 社Kit)

図2 DNA Cleaner による高分子量DNA 断片の精製
本品を使用した結果、200bp 以上のDNA 断片を効率よく回収できた。

3)少量DNA の回収効率比較

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[使用したDNA]
3kb プラスミド

[DNA 量測定法]
OD260/OD280 で吸光度測定し、回収されたDNA 量を推定した。

図3  DNA Cleaner によるプラスミドDNA の添加回収試験
本品を使用し、100 〜 2,500ng のDNA 回収実験を行った結果、Q 社Kit よりもDNA を効率よく除去でき、500ng 以上のDNA 回収率は90% 以上であった。

価格情報

コードNo. 品 名 容 量 希望納入価格(円)
045-30741 DNA Cleaner 5mL 25,000
044-30711 25bp DNA Step Ladder (25-500bp) 500μL(100レーン用) 18,000

*表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
*表示している希望納入価格は2012年12月の価格です。最新価格は「製品検索」からコードNo.で検索してご確認ください。

※ランニングコスト(5mL)
処理前核酸溶液の容量に依存します。下記をご参考ください。
10μLのとき → 500回分(50円/精製)
50μLのとき → 100回分(250円/精製)
100μLのとき → 50回分(500円/精製

掲載されている試薬は、試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。最新価格は「製品検索」からコードNo.で検索してご確認ください。

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