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試薬ホーム > 製品情報 > 遺伝子 > microRNA Isolation Kit, Human Ago2 microRNA ‘‘特異的’’ 精製キット
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| 従来法 | microRNA Isolation Kit, Human Ago2 | |
| Total RNA 抽出工程 | 要 | 不要 |
| small RNA(≦200nt)の濃縮・精製 | 要 | 不要 |
| 変性アクリルアミドゲル作製 | 要 | 不要 |
| 変性アクリルアミドゲルからの切出し抽出 | 要 | 不要 |


図1. microRNA Isolation Kit, Human Ago2を用いて、ヒト培養細胞株3 種類(HeLa、HepG2、HEK293)、およびマウス培養細胞株(P388D1)から精製したmicroRNA 画分をUrea-PAGE によって検出した。その結果、ヒト培養細胞から特異的にmicroRNA が精製できた。使用細胞数は5×106 相当。

. rRNA……rRNA 分解断片のcDNA
. tRNA……tRNA 分解断片のcDNA
. Unknowns……ゲノム配列に一致しないcDNA
. Others ……… ゲノム配列に一致し、miRBase に未登録のcDNA
図2. microRNA Isolation Kit, Human Ago2 により、HeLa 細胞から精製したmicroRNA 画分をもちいてmicroRNA
Cloning
Kit Wako でクローニングし、small RNA の分布を解析した。ランダムに選抜した95 クローンからプラスミドを抽出し、塩基配
列を解析した後,データベース(Sanger miRBase)と照合したところ、95 クローン中89 クローン(全体の93.7%)が
microRNA であることを確認した。89 クローンの内訳は表1を参照。
3)ヒト組織のmicroRNA精製
下記プロトコールにより、ヒト組織(Liver, Testis)からmicroRNA画分を精製した。
【ヒト組織抽出液の調整】
ヒト凍結組織約50mg(Liver, Testis)
↓←1mL Cell Lysis Solution
破砕(テフロンホモジナイザー使用)
↓←1mL Cell Lysis Solution
15分間 氷上で静置。
↓遠心分離(14,500rpmまたは20,000×g, 4℃, 20分)
上清を回収する。
↓
0.45μmのフィルターでろ過する。
↓
新しい2.0mLチューブに回収する。(細胞溶解液)
【抗体ビーズの使用前洗浄】
1) Anti Human Ago2 Antibody Beads Solution 50μLを1.5mLマイクロ遠心チューブに移す。
2) 4℃、5,600rpm(3,000 ×g)で30秒間遠心分離し、上清を除く。
3) ビーズペレットをCell Lysis Solution 1mLで懸濁し、4℃、5,600rpm(3,000 ×g)で30秒間遠心分離後、上清を除く。(洗浄済みビーズ溶液)
【microRNA画分の精製】
a) 抗原-抗体反応
1) 前洗浄済みAnti Human Ago2 Antibody Beads Solutionに、1mL 細胞溶解液(組織25mg由来) を添加しボルテックスミキサーで懸濁する。
2) 4℃でローテーターにより転倒混和し、3時間抗原抗体反応を行う。
3) 4℃、5,600rpm(3,000 ×g)で30秒間遠心分離し、上清を除く。
b) 反応後の洗浄
1) ビーズペレットにCell Lysis Solution 1mLを添加し、ボルテックスミキサーで懸濁する。
2) 4℃、5,600rpm(3,000 ×g)で30秒間遠心分離し、上清を除く。
3) 1)〜2)の操作をさらに2回繰り返す。洗浄操作は計3回行う。
c) 抗原溶出とmicroRNAの精製
1) ビーズペレットにElution Solution(注1)50μLを添加し、ボルテックスミキサーで懸濁する。
2) 4℃、5,600rpm(3,000 ×g)で30秒間遠心分離し、上清を1.5mLマイクロ遠心チューブに移す。(注2)
3) 滅菌水350μL、フェノール:クロロホルム:イソアミルアルコール (25:24:1) 400μLを添加し、ボルテックスミキサーで懸濁する。
4) 室温、14,500rpm(20,000 ×g)で10分間遠心分離する。
5) 上層(水層)を1.5mLマイクロ遠心チューブに移し(注3)、クロロホルム400μLを添加し、ボルテックスミキサーで混合する。
6) 室温、14,500rpm(20,000 ×g)で10分間遠心分離する。
7) 上層(水層)を1.5mLマイクロ遠心チューブに移し、Ethachinmate 3μL、3 mol/L Sodium Acetate 40μL、99.5%
エタノール1mLを添加し、ボルテックスミキサーで混合する。
8) 4℃、14,500rpm(20,000 ×g)で15分間遠心分離し、上清を除く。
9) 沈殿に70% エタノール 溶液1mLを添加し、ボルテックスミキサーで混合する。
10) 4℃、14,500rpm(20,000 ×g)で10分間遠心分離し、上清を除く。
11) チューブの蓋を開けて室温で20分間放置し、ペレットを風乾する。
12) ペレットを滅菌水、またはTEバッファー10μLに溶解する。(注4)
注1.Elution Solutionは冷蔵保存により成分が析出していますので、使用前に室温に戻し、ボルテックスミキサーで攪拌後、成分が完全に溶解していることを確認してから使用してください。
注2.上清をマイクロピペッターで吸う際に、ビーズペレットを吸わないように注意してください。ビーズに非特異吸着した核酸が混入する場合があります。
注3.上層(水層)をマイクロピペッターで吸う際に、中間層を吸わないように注意してください。
注4. 溶解後のサンプルは-80℃で保存してください。

Lane1: Single strand RNA (22nt), 1ng
Lane2: Liver lysate.
Lane3: Testic lysate.
図3. microRNA Isolation Kit, Human Ago2を用いて、ヒト組織(Liver, Testis)から精製したmicroRNA 画分をUrea-PAGE によって検出した。スタートの組織使用量は50mgで、最終の細胞溶解液2mLを得た。そのうち1mLを免疫沈降反応に使用し、最終のRNA画分量を10μLに調製した。そのうちの5μLをUrea-PAGE に供した。
HeLa細胞 (1×10^5〜1×10^7 cells)から「microRNA Isolation Kit, Human Ago2」を使用してmicroRNA-Ago2複合体を回収した後、添付プロトコルに従ってmicroRNAを精製、「"3D-Gene®"Human miRNA Oligo chip (東レ株式会社)」にて解析した。
<銀染色における電気泳動データの検出状況>
| sample | 1×10^5 cells | 1×10^6 cells | 1×10^7 cells |
|---|---|---|---|
| 検出状況 | × | △ | ○ |
<検出スポットのスキャン画像>

microRNA Isolation Kit, Human Ago2にて精製・回収されたmicroRNAを、高感度検出に優れている"3D-Gene®:"Human miRNA Oligo chipにて解析したところ、銀染色では検出が難しかった105個の細胞数でも300種類以上のmicroRNAが検出された。
細胞数に関しては106個以上の系において、Total RNAを使用する系で検出されにくい成熟microRNAが濃度依存的に検出された。
本結果から、濃縮キットと高感度DNAチップを組み合わせることでmicroRNAの研究における新たな機能解析が可能となることが示唆された。
| コードNo. | 品 名 | 容 量 | 希望納入価格(円) |
|---|---|---|---|
| 292-66701 | microRNA Isolation kit, Human Ago2 | 10回用 |
45,000 |
| 014-22023 | Anti Mouse AGO2, Monoclonal Antibody(2D4) (NEW
!!) |
50μL |
30,000 |
| 018-22021 | 100μL |
50,000 |
|
| 011-22033 | Anti Human AGO2, Monoclonal Antibody(4G8) (NEW !!) | 50μL |
30,000 |
| 015-22031 | 100μL |
50,000 |
|
| 290-66501 | microRNA Cloning kit Wako | 8回用 |
63,000 |
| 298-65103 | Single Strand DNA Ligase, thermostable, recombinant, Solution | 200units |
43,000 |
| 292-65101 |
500units |
87,000 |
*Anti Human AGO2, Monoclonal AntibodyはコードNo.を変更いたしました。旧コードNo. 016-20861(50μL) → 新コードNo. 011-22033(50μL)。
*希望納入価格には消費税等が含まれておりません。
● 本文に収載しております試薬は、試験・研究の目的にのみ使用されるもので、「医療品」、「食品」、「家庭用品」などとして使用できません。
● 希望納入価格には消費税等が含まれておりません。

注・・・この実験結果はmicroRNA Isolation Kit, Human Ago2を使用したものではありません。
図. 4 抗ヒトAgo2モノクローナル抗体を用いて、ヒト培養細胞株4種類(HeLa、HepG2、HEK293、THP-1)、およびマウス培養細胞株(P388D1)から免疫沈降法により取得したタンパク質を、SDS-PAGEおよびWestern Blotにより検出した。ヒト培養細胞から特異的にAgo2タンパク質が回収でき、マウスAgo2には反応せずヒトAgo2特異的であることを確認した。各細胞株の細胞数は5×106相当。
■ 抗ヒトAGO2, モノクローナル抗体(4G8)に関する参考文献
1)Miyoshi, K. et al. : Methods Mol Biol, 442, 29- 43(2008).
2) 和光純薬時報, 74(4), 2-4(2006) .
■ AGOファミリータンパク質に関する参考文献
1) Fire, A. et al. : Nature, 391 , 806 - 811(1998).
2) Gil, J. and Esteban, M. : Apoptosis, 5 , 107 - 114(2000).
3) Elbashir, S. M. et al. : Nature, 411 , 494 - 498(2001).
4) Dykxhoorn, D. M. and Lieberman, J. : Cell, 126 , 231 - 235(2006).
5) Gregory, R. I. et al. : Cell, 123, 631- 640(2005).
6) Rand, T. A. et al. : Cell, 123, 621 - 629(2005).
7) Tomari, H. and Zamore, P. D. : Genes Dev., 19 , 517 - 529(2005).
8) Hammond, S. M. : FEBS Letter, 579 , 5822 -5829(2005).
9) Ambros, V. : Nature, 431 , 350 - 355(2004).
10) Liu, J. et al. : Nature Cell Biol., 7, 1261- 1266(2005)
11) Liu, J. et al. : Science, 305 , 1437 - 1441(2004).
12) Carmell, M. A. et al. : Genes Dev., 16 , 2733 -2742(2002).
13) Yuan, Y-R. et al. : Mol. Cell, 19, 405- 419(2005).
14) Song, J-J. et al. : Science, 305, 1026- 1032(2004).
15) Miyoshi, K. et al. : Genes Dev., 19 , 2837 -2848(2005).
16) Saito, K. et al. : Genes Dev., Epub Aug 1(2006).
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