和光純薬工業株式会社試薬 [Laboratory Chemicals] 試験研究用試薬・抗体の製造販売および各種受託サービス
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非バイアス 次世代 TCR/BCRレパトア解析

次世代シーケンサーを用いたT細胞受容体(TCR)およびB細胞受容体(BCR)遺伝子の多様性解析(レパトア解析)の受託を行うサービスです。Adaptor-ligation PCR法を用いることで、定量性に優れた非バイアスのレパトア解析を提供します。
特定のTCRやBCRを遺伝子レベルで同定できるため、白血病や悪性リンパ腫における微小残存病変(MRD)の検出に有効です。


特長

次世代シーケンサーを用いたTCR、BCR遺伝子のレパトア解析を行います。
検体をお預かりし、レパトアジェネシスにてレパトア解析、データ解析を完了した後、結果をご報告いたします。
ヒト、マウスの血液、組織、培養細胞、ソート細胞のTotal RNAを解析に用います。
一つの検体で最大11項目(TCR:α、β、γ、δ、BCR:IgM、IgG、IgA、IgD、IgE、IgL、IgK)のレパトア解析が可能です。
ご希望により納期の短縮(通常2 ヶ月、最速2 週間)も可能です。

<原理>非バイアス次世代レパトア解析

1:TCR、BCR遺伝子の多様性
TCR、BCR遺伝子は、ゲノム上では多数のV(variable)、D(diversity)、J(joining)およびC(constant)の遺伝子断片からなります。分化、成熟の過程で遺伝子再構成が行われ、それぞれ1つずつがランダムに選ばれて結合します。さらにV-D間、D-J間にランダムに塩基の挿入や欠失が起こり、遺伝子の多様性が高まります。その程度はTCRで10の18乗、BCRで10の14乗におよびます。次世代レパトア解析では、この多様性を塩基配列レベルで網羅的に解析します。


2:3つの技術
非バイアス遺伝子増幅、次世代シーケンサー、バイオインフォマティクスの3つの技術から成り立ちます。非バイアス遺伝子増幅では、1セットのプライマーで全TCR遺伝子を増幅するAdaptorligation PCR法を採用しています。本法ではMultiplex PCR法のような多数のプライマー間で生じるバイアスが原理的に発生せず、さらにBCR遺伝子で問題となるポイントミューテーションによるミスハイブリの心配もありません。次世代シーケンサーは、500-600 bpのロングリード解析ができるMiSeq(illumina)、GSJunior(Roche)を採用し、1つのリードでV、D、J、C領域をアサインメントします。バイオインフォマティクスでは、レパトア解析専用ソフト「Repertoire Genesis」を独自開発し、レパトアジェネシス内の専用サーバーで解析します。

用途例


サービスの流れ

 お見積もり 
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検体種類、検体数、解析項目数、納期をお伺いし、お見積もりを提出します。
 ご発注 
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見積もり内容をご確認の上、お客様が和光純薬工業の受託解析サービスへ発注します。
 検体発送 
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お客様がRepertoire Genesisに検体を発送します。
 RNA抽出、QC 
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レパトアジェネシスにてTotal RNA抽出、品質チェックを行います。品質に問題がある場合はご連絡させていただく場合もございます。
 レパトア解析 
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レパトアジェネシスにて非バイアス次世代レパトア解析を実施します。
 納品 
解析が完了した時点でお客様にご連絡、解析結果を報告書とDVDにて納品いたします。

ご提供いただくもの

ヘパリン等で凝固防止された血液
RNAlater等のRNA安定化試薬で保管された組織検体
ISOGEN等のRNA抽出試薬で溶解された検体
ご自身で抽出されたTotal RNA

※ Total RNAは大変分解されやすいものであり、分解されてしまいますと良好な解析結果を得ることができません。検体を適切に処理、発送するためのプロトコールをレパトアジェネシスホームページ内に準備しております。検体処理を開始する前に必ずご確認ください。

ご注文方法

和光純薬工業の受託解析サービスへご連絡ください。
受託サービス見積依頼書をご利用ください。

価格/納期


納品物

納品書、解析報告書
DVD(シーケンスデータ、レパトア解析データ、集計データ)

実施例

BALB/cでは、マウス乳がんウイルス(mtv)による特定のβ鎖V遺伝子欠損を有する。C57BL/6とのレパトアの傾向を比較した。

健常者PBMCにおけるTCRα鎖β鎖レパトア解析例(VJレパトア3Dグラフ、ランキング)

 

掲載されている試薬は、試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。最新価格は「製品検索」からコードNo.で検索してご確認ください。

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和光純薬工業株式会社

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