和光純薬工業株式会社試薬 [Laboratory Chemicals] 試験研究用試薬・抗体の製造販売および各種受託サービス
製品カタログ 試験研究用試薬・抗体 請求
試薬ホーム  >  製品情報  >  ライフサイエンス  >  遺伝子  >  BioSpyder TempO-Seq™ Gene Expression Platform

遺伝子発現プロファイリングのための新ツール
BioSpyder TempO-Seq™ Gene Expression Platform

タイトル

TempO-Seq™は、FFPE組織などの低品質のRNA、微量RNAからの解析を可能にする 次世代シーケンスライブラリー作製キットです。
高度に設計されたディテクターオリゴを用い、数百の遺伝子からトランスクリプトームまで 簡便にハイスループットな発現解析が行えます。


特長

  • cDNA合成は不要。Total RNAから直接ディテクターオリゴでキャプチャーします。
     ⇒低品質のRNAからも解析が可能、再現性の高い結果が得られます。

  • 劣化したRNA、微量のRNAの解析可能。
     ⇒最適化したディテクターオリゴを用いるため、FFPE組織由来RNAなどの低品質・微量のサンプルの解析が可能です。

  • ターゲット領域のカウントにフォーカスすることで、シーケンサーのスループットを最大化。
     ⇒従来のRNA-Seqと同等の精度で、より多くの検体を解析できます。

  • シンプルなプロトコル。
     ⇒トータルRNAを出発材料として6時間でシーケンス解析用ライブラリが作製できます。
      ハンズオン時間はわずか1時間です。培養細胞の場合、RNA抽出も不要です。

適用サンプル

  • ホルマリン固定パラフィン包埋切片、血液、だ液の場合
     各試料からtotal RNAを抽出・精製してインプットサンプルを調製して下さい。

  • 培養細胞の場合
     本キット添付のTempO-Seq Lysis Bufferを使用して細胞破砕液を調製して下さい。
     この細胞破砕液をインプットサンプルとし、total RNAを精製する必要はありません。

適用機器

  • Illumina社
     HiSeqシステム
     MiSeqシステム

アウトライン

パフォーマンス

RNA-Seqとの相関


MAQC Universal Reference RNAとMAQC Brain Reference RNA、それぞれ3サンプルをTempO-Seq™ Whole Transcriptome パネル(~200 reads/expressed gene)とRNA-Seq(~1,000 reads/expressed gene)で解析した。
2種のRNAサンプル間の違いをDESeqで定量し、それぞれの方法で検出されたFold Changeを遺伝子ごとにプロットした。

●RNA-Seqと高い相関
●80%少ないリード量
再現性

Human Whole Transcriptomeパネルを用いて2種類のMAQC Reference RNA(Universal Reference、Brain Reference)の解析を行った。

●高い再現性(R2>0.97)
●低いバックグラウンド)

劣化RNAからの解析

FFPE組織と凍結組織の比較

イメージ


同一ラット肝臓由来の凍結組織切片とFFPE組織切片で2,300遺伝子の解析を行った。



●固定による影響は見られなかった
●FFPE組織からも解析可能!


加熱分解サンプルの検証



●95℃、60分間加熱処理した検体でも、検出量が2倍以上減少したものは見られなかった
●損傷の激しいRNAからも解析可能!

RNA量の検証

MAQC Universal Reference RNAを用いて、100ngから100fgのRNAで解析を行った。


●シングルセル相当のRNA(10pg)からも解析可能!

ラインアップ

メーカーコード 品 名 プローブ数 ターゲット
遺伝子数
Reads/Sample 容 量 希望納入価格
はこちら
DO-02-024 refrigeratorHuman Whole Transcriptome Kit 20,629 18,886 genes 2.5m
(250 avg counts/gene,
50% expressed)
24 samples
(24 Index)
DO-02-048 48 samples
(48 Index)
見積り
DO-02-096 96 samples
(96 Index)
見積り
DO-01-024 refrigeratorHuman Surrogate + Tox Panel Kit 2,996 2,675 genes
(On the S1500+Ver2 gene list
selected by the Tox21 Consortium)
1.1m
(500 avg counts/gene, 80% expressed)
24 samples
(24 Index)
DO-01-048 48 samples
(48 Index)
DO-01-096 96 samples
(96 Index)
見積り
DO-03-024 refrigeratorMouse Surrogate + Tox Panel Kit 3,045 2,754 genes 1.1m
(500 avg counts/gene, 80% expressed)
24 samples
(24 Index)
DO-03-048 48 samples
(48 Index)
DO-03-096 96 samples
(96 Index)
見積り

*本キットは体外診断用ではありません。
*希望納入価格には消費税等が含まれておりません。
*本キットはIllumina社機器に対応するシーケンス解析用ライブラリーを作製するキットです。
*Reads/Sampleは検体や条件により異なります。
*他容量もございます。詳しくはsiyaku.comをご参照下さい。

関連製品


ニッポンジーン ISOGENシリーズ


コードNo. 品名/概要 容量 希望納入価格(円)
315-02504  

ISOGEN
 ヒト、動物、植物及び細菌からのRNA抽出用試薬。一連の操作で、RNA、DNA、タンパク質の単離が可能。
10mL 5,600
317-02503 50mL 19,000
311-02501 100mL 28,000
314-07513   

ISOGEN with Spin Column
 ヒト、動物、植物及び細菌からのRNA抽出用試薬。一連の操作で、RNA、DNA、タンパク質の単離が可能。スピンカラムとの組み合わせにより、より高純度のtotal RNAを抽出することが可能。
10回用 16,000
318-07511 50回用 40,000
317-07363   

ISOGEN U
 動物細胞及び培養細胞からのtotal RNA抽出及びsmall RNA・高分子RNA分画に使用。
10mL 9,000
311-07361 100mL 28,000
317-02623   

ISOGEN-LS
 血液や血清のような液体試料からのRNA抽出用試薬。
10mL 5,600
311-02621 100mL 32,000
315-06421   

ISOGEN PB Kit
 パラフィン包埋組織切片からRNAを抽出するための試薬キット。
20テスト 22,000
315-08001  

ISOSPIN PCR Product
 スピンカラムを用いてPCR反応液中のPCR産物を精製するためのキット。
100回用 18,000

*本キットは体外診断用ではありません。
*希望納入価格には消費税等が含まれておりません。

 

掲載されている試薬は、試験・研究の目的のみに使用されるものであり、「医薬品」、「食品」、「家庭用品」などとしては使用できません。
表示している希望納入価格は「本体価格のみ」で消費税等は含まれておりません。
表示している希望納入価格は本記事掲載時点の価格です。最新価格は「製品検索」からコードNo.で検索してご確認ください。

試薬ホーム  >  製品情報  >  ライフサイエンス  >  遺伝子  >  BioSpyder TempO-Seq™ Gene Expression Platform

和光純薬工業株式会社

本社〒540-8605大阪市中央区道修町三丁目1番2号       TEL 06-6203-3741(代表)
東京本店〒103-0023東京都中央区日本橋本町二丁目4番1号 TEL 03-3270-8571(代表)
●九州営業所 092-622-1005(代) ●中国営業所 082-285-6381(代) ●東海営業所 052-772-0788(代)
●藤沢営業所 0466-29-0351(代) ●筑波営業所 0298-58-2278(代) ●東北営業所 022-222-3072(代)
●北海道営業所 011-271-0285(代)
E-mail: labchem-tec@wako-chem.co.jp URL: http://www.wako-chem.co.jp
フリーダイヤル: 0120-052-099 フリーファックス: 0120-052-806